当车牌被套牌并且出现违章时，做车牌建议应采取以下措施：
及时向机动车注册所在地的交警部门举报备案，交警部门会展开调查，确认是否真正被套牌。如果确认被套牌，将车号录入套牌车受案信息，并可能免于处罚。
搜集证据，包括车辆外观照片、停车小票、高速收费小票、行车记录仪、监控录像等，以证明自己的车辆被套牌。
向交管部门提交申诉，可以选择车辆登记所在地的交管部门申诉，也可以去违章所在地进行申诉。在申诉时，提供相关证据。
申请更换车辆牌号。申诉成功后，交管部门会开具一个车辆被套牌说明。凭这个说明，可以到车管所申请更换牌号。
定期检查自己的违法记录，一旦发现有异常的违法行为，很大可能你就是被套牌了。
通过上述步骤，可以有效地处理车牌被套牌及由此产生的违章问题。同时，建议车主定期查看自己车辆的交通违法记录，及时发现并处理可能的套牌情况。